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| <<Informazioni(rilasci="20.04 20.10")>> | <<Informazioni(forum="https://forum.ubuntu-it.org/viewtopic.php?f=46&t=644949")>> |
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| Per poter aggiungere funzionalità all'ambiente [[AmbienteGrafico/Gnome|GONME]] è possibile installare delle estensioni. Tipicamente le estensioni sono installabili dal sito [[https://extensions.gnome.org/|GNOME Extensions]] (verrà mostrato come usufruirne), tuttavia '''Ubuntu''' ne presenta alcune preinstallate nel classico formato [[AmministrazioneSistema/InstallareProgrammi/PacchettiDebian|.deb]]. | Questa pagina presenta una lista di software utilizzabili su Ubuntu utili nell'ambito della biologia. |
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| In questa guida verrà mostrato quali estensioni siano già presenti sul sistema, come installarne di nuove e come attivarle/disattivarle. | = Software = |
| Linea 13: | Linea 13: |
| {{{#!wiki important Nonostante le estensioni siano frequentemente utilizzate dagli utenti, è opportuno ricordare che il loro utilizzo potrebbe non essere esente da malfunzionamenti. }}} |
== AMBER == |
| Linea 17: | Linea 15: |
| = Estensioni preinstallate = | * '''Sito''': https://ambermd.org * '''Disciplina''': chimica computazionale e biologia strutturale. * '''Descrizione''': software per simulazioni di dinamiche molecolari, molto impiegato per la robustezza e l’affidabilità dei ''forcefield'' che implementa. |
| Linea 19: | Linea 19: |
| Vengono qui riportate le estensioni preinstallate in Ubuntu in formato `.deb`. | == Bioblender == |
| Linea 21: | Linea 21: |
| <<Anchor(icone_desktop)>> == Desktop Icons == * Pacchetto di installazione: [[apt://gnome-shell-extension-desktop-icons|gnome-shell-extension-desktop-icons]] L'ambiente '''GNOME''' nelle versioni più recenti non prevede l'utilizzo di file sul desktop. Questa estensione ne permette l'utilizzo. === Problemi noti === * '''Mancanza drag & drop''': l'applicazione non permette di trascinare file dal desktop alle cartelle e viceversa.<<BR>>Diversi utenti preferiscono utilizzare al suo posto la più recente [[https://extensions.gnome.org/extension/2087/desktop-icons-ng-ding/|Desktop Icons NG (DING)]] che integra queste funzionalità. In tal caso, per evitare conflitti (in certi casi lo sdoppiamento delle icone sul desktop) è consigliabile disinstallare l'applicazione originale digitando nel [[AmministrazioneSistema/Terminale|terminale]]:{{{ sudo apt purge gnome-shell-extension-desktop-icons }}} * '''Bug in Ubuntu 20.10 - [risolto]''': se si è appena installata Ubuntu 20.10 a causa del bug [[https://bugs.launchpad.net/ubuntu/+source/gnome-shell-extension-desktop-icons/+bug/1898462|1898462]] tentando di trascinare file dal desktop verso cartelle e viceversa (funzionalità comunque non prevista), si avrà un crash del desktop che obbligherà al riavvio forzato del sistema.<<BR>>Il bug è stato nel frattempo risolto, pertanto sarà sufficiente effettuare gli [[AmministrazioneSistema/Aggiornamenti|aggiornamenti]] di sistema per correggere il pacchetto. == Ubuntu Dock == == Ubuntu Appindicators == |
* '''Sito''': http://www.bioblender.org * '''Disciplina''': Chimica computazionale e biologia strutturale. * '''Descrizione''': Add-on di Blender. Pacchetto per il rendering e la modellazione di biomolecole. |
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| * [[Repository|Guida ai repository]] * [[Ubuntu+1|Informazioni sulla versione in fase di sviluppo]] * [[Repository/SourcesList/EOL|File sources.list nelle versioni EOL]] |
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| CategoryAmministrazione | CategoryHomepage |
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Introduzione
Questa pagina presenta una lista di software utilizzabili su Ubuntu utili nell'ambito della biologia.
Software
AMBER
Sito: https://ambermd.org
Disciplina: chimica computazionale e biologia strutturale.
Descrizione: software per simulazioni di dinamiche molecolari, molto impiegato per la robustezza e l’affidabilità dei forcefield che implementa.
Bioblender
Disciplina: Chimica computazionale e biologia strutturale.
Descrizione: Add-on di Blender. Pacchetto per il rendering e la modellazione di biomolecole.
